药物介导肝损伤预测模型构建

发布时间:2023-07-18 15:04:09    来源:

 

题目名称

药物介导肝损伤预测模型构建

作品形式

算法模型

赛题简介

赛题背景:

药物介导的肝损伤会导致肝衰竭甚至死亡。由于药物介导的肝损伤成因复杂,发病机制不清,目前仍缺少能够准确判定药物是否能够造成肝损伤的药理模型。开发药物介导肝损伤的预测软件/模型能够对药物及药物杂质的肝毒性进行快速的评估,有助于发现化合物潜在的肝损伤风险,保证用药安全。

本数据库中包含了部分已上市药物与肝损伤相关的信息,并分为了训练集、验证集共两个数据集,可用于分析与肝损伤相关的特征,建立肝毒性预测软件/模型。

数据简介:

训练集中,肝损伤终点(label)共分为A-E五个等级。其中:

A表示已知能够导致肝损伤;

B表示极有可能导致肝损伤;

C表示可能导致肝损伤;

D表示不太可能导致肝损伤;

E表示没有证据显示能够造成肝损伤;

EA,肝损伤的可能性依次增强。

验证集的肝损伤终点(label)共分为01两类。0代表可能没有肝毒性,1代表可能具有肝毒性。训练集可用于模型训练,验证集可用于评估模型的泛化能力。

除了肝损伤终点外,在两个数据集中,还包含了各个药物的结构信息(smiles)用于分析。

  

参赛要求:

参赛同学需利用所学知识,根据数据库内容,构建肝损伤预测软件/模型。

要求1:在本赛题数据范围内进行分析;

要求2:算法开发流程应清晰、合理,构建过程应展示在PPT中,必要时应提供训练/预测/可靠性分析等结果;

要求3:建立的模型/软件应能够对任意指定化合物(smiles)的肝损伤风险进行评估和预测,并提供原始代码和用户手册;

要求4:软件/模型可移植性好,便于安装和使用。若有交互界面应美观友好,

参赛团队需提交以下文件:

1. 团队及软件/模型介绍PPT

2. 原始代码和用户手册;

3. 训练及预测结果。

 

关联数据资源

药物介导肝损伤数据

 

文件类型: .xlsx 训练集.xlsx (55.69 KB)

 

 

文件类型: .xlsx 验证集.xlsx (27.09 KB)

 

出题单位

国家药品监督管理局信息中心、中国食品药品检定研究院

联系人

唐桃群、张庆生

联系电话

010-88331966010-53851375

联系邮箱

tangtq@nmpaic.org.cnzqs@nifdc.org.cn